重点实验室建设依托暨南大学，实行学术委员会领导下的学术研究室负责人责任制。学术委员会与项目总负责人共同协作，负责决定各研究室负责人及分题项目负责人的选任。负责人主要负责组织科研计划的执行，并确保科研项目的顺利推进与圆满完成。实验室负责人之间采用集中协商、集中决策、单独管理、统一监督的管理模式。项目总负责人在整体工作中担任总协调和总负责的角色，负责统筹各项科研任务的落实。各研究室负责人在协作决策时，需参与集中讨论，形成项目组织实施方案，并根据共同决策统一执行项目管理制度及运作规范。各研究室负责人根据相应的制度和规范，对自己负责的任务进行单独管理，确保各项科研工作的高效运行。同时，学术委员会及项目总负责人对重点实验室的整体实施进度和实施质量进行统一监督，确保科研项目按计划推进，取得高质量的成果。

学术委员会设有主任委员1名、副主任委员2名、委员12名和秘书1名。重点实验室管理团队包括主任1名，副主任3名，兼职秘书1人，财务助理1人，科研助理2人，科研团队由专职科研人员、兼职科研人员与访问学者构成。